6月4日上午,美國肯塔基大學湛昌國教授作客理學院,在逸夫樓二樓學術報告廳作了題為“Roles of Computational Modeling and Simulation in Modern Drug Design, Discovery, and Development”的學術報告,理學院位燈國教授主持了本次報告。
報告上,湛昌國教授介紹了課題組發現的靶向激活Par-4蛋白引起腫瘤細胞自噬的天然産物分子Arylquins。Par-4蛋白能夠選擇性殺死癌細胞,對正常細胞沒有毒性。但在人體當中,Par-4蛋白被纖維蛋白結合而不能殺死癌細胞。Arylquins能夠結合纖維蛋白,使之釋放Par-4,從而達到抗腫瘤的效果。由于Par-4蛋白半衰期短。湛老師課題組從抗體具有活性高、半衰期長-等特征中得到啟發,通過氨基酸序列的改造,提高了Par-4半衰期,并且保持活性不變。接着,湛教授引用文獻報道的蛋白質“stability-function trade-off”理論,表示一般蛋白穩定性高,則剛性比較強;活性較高的,柔性比較強。湛教授課題組通過分析分别決定蛋白穩定性和活性的氨基酸,并對其進行突變,得到同時提高穩定性和活性的新蛋白。随後,湛昌國教授介紹了革蘭氏陽性菌和陰性菌外層膜結構的區别,并就目前抑制革蘭氏陰性菌所面臨的困境原因做了解讀,他們課題組從機制出發,以革蘭氏陰性菌細胞膜蛋白離子通道泵結構為靶點,通過計算機虛拟篩選,設計了一個抑制泵運轉的化合物,卻發現該化合物不能有效跨膜從而無法成藥。于是,湛教授進而提出将通過機器學習方法,篩選出靶向革蘭氏陰性菌的活性小分子。最後,湛昌國教授告誡我們:想通過計算機預測的方法設計小分子,設計者必須了解具體的生理生化機制,隻有這樣,才能充分提高計算的成功率,有更大的可能性得到高活性小分子。
最後,湛老師介紹了課題組人員組成、合作者以及科研經費來源,并予以感謝。報告結束後,與會師生還就聽取報告、自己科研工作中遇到的問題與湛昌國教授進行了深入交流。
【簡介】湛昌國,美國肯塔基大學藥學院(University of Kentucky College of Pharmacy)教授,分子模拟與生物醫藥中心、化學信息學與藥物設計中心主任。美國聖母大學化學博士和日本分子科學研究所分子物理學博士,曾在哥倫比亞大學醫學系進行了博士後研究。2007年晉升為肯塔基大學藥學院教授,2010年當選美國制藥科學家協會(AAPS)會員(Fellow of American Association of Pharmaceutical Scientists ),并獲得2016年AAPS藥物發現與開發界面研究成果獎(AAPS Research Achievement Award in Drug Discovery and Development Interface )。 湛教授綜合使用計算和實驗方法,設計、發現和開發小分子藥物以及活性工程蛋白。目前,已有兩種藥物應用于人類臨床II期試驗,一種已經獲得了突破性的FDA治療設計(Breakthrough Therapy Designation by the FDA )他擔任多個期刊的編委會成員,在 Nature Chem. Biol、Proc. Natl. Acad. Sci、Nature Commun等雜志上發表300多篇文章,已獲得37項專利或專利申請。
文字作者:劉思思 審核人:位燈國